南京博物院拥有六个博物馆，其中历史馆、艺术馆、特展馆是传统意义上的博物馆，是以物质文化为基础，传递文化价值的博物馆，而民国馆、非遗馆和数字馆则是活态博物馆，不仅仅是用来看的博物馆，更是可以使用的博物馆。
       南京博物院数字博物馆建立的基础理念，用两句话概括就是：弥合公众与博物馆的距离，为未来保留现代个体标本。数字馆采用实体博物馆和虚拟博物馆完全融合的建设模式，通过网络连接实体博物馆和虚拟博物馆。
       数字馆在建设过程中，摸索出了一套办法，就是建立统一的网络平台，提供统一的软件服务，提供统一的保存传输方式，这样就有可能为全省博物馆建立数字博物馆提供支持，同时由于文物的差异性，又使得各家博物馆保持自身的特点。
       对于熟练使用智能手机的年轻人，可以充分玩转数字馆，除了可以阅读扫描二维码得到的展项解说，还可以上传自己想表达的内容到展览中，更可以操作展项内容，带来自己的手机可以控制博物馆内容展示方式的新奇体验。对于孩子们，数字馆提供了活动的缩微模型、手势控制游戏、烧制陶器、拼图等游戏。
       数字馆里还充分利用了传统的手段来表现主题。在宗教展区，利用镜面反射，形象地诠释了宗教与人的关系，表达了宗教基本的诉求，就是宗教的根本是以人为中心，以善为基础，以平和、美好为追求，人类几大宗教是整合的、是相依存的，而不是仇恨、战争。